第三，招标机构为了避免承担评标中出现的错误等责任，建设单位害怕以后工程建设实施过程中由于甲方原因（如设计变更等）而造成中标单位的索赔等诸多麻烦，都不愿意采用合理的最低价中标方法，所以要尽快制定赔偿制度和索赔与反索赔的规定，建立行业自律机制和行业协会以及合同争议的评审、调解机构，坚决按社会主义市场化的经济规律和原则办事。
3.4.2 将招投标工作与工程承包合同管理有机地连接起来
招投标工作与工程承包合同的管理是工程建设阶段不可分割的两大部分，由于上海市水利工程招标文件的编制主要是由招标代理机构承担，承包合同管理由监理单位承担，造成了招标工作和合同管理的脱节，这对项目法人的总体利益是不利的。在承包合同实施过程中，一方面由于监理工程师未参与招标工作、不熟悉招标文件和合同，在执行合同初期不能很快地进入监理角色，只能边上岗边学习；另一方面由于编制招标文件的招标代理机构不参与合同管理，招标文件编制的质量没有实践的检验，招标文件的编制水平就很难提高，这给监理工程师进行合同管理造成了很多困难，给工程合同变更和索赔带来很大的隐患，许多工程在完工之后，工程合同与原来招标文件已大相径庭，违背了招标单位在招标时的初衷。笔者认为，招标工作应与工程承包合同管理有机地连接起来，虽然目前招标代理机构与监理公司合并困难较大，不符合现实，但监理工程师作为专家参与招投标工作全过程应该是可行的，而招标代理机构对工程造价的控制可以延续到工程竣工决算阶段，由招标代理机构来参与工程竣工决算的审核。
3.4.3 引进竞争机制，激励投标单位向高质量和技术创新方向发展
目前水利工程招投标过程中，存在着“严进宽出”的现象，即招标很严，中标很难，中标之后工程质量能否达到投标时的承诺，就没有很强的约束措施，同时也不影响下次的投标，“严进宽出”的后果，使得投标者越来越追求投标的技巧，而忽视企业的业绩，笔者认为在加强工程合同管理的同时，要引市场优胜劣汰的机制，对那些业绩好，获得国家级、市级工程优质奖的投标单位，应在以后一定时期的招投标中给予评标加分或优先推荐的奖励，对那些业绩不好、发生过质量事故或安全事故、屡次违约的投标单位，应实行评标减分或取消投标资格，以激励投标单位向高质量和技术创新方向发展。
3.4.4 逐步推广建设单位、管理运行单位及养护单位招投标制
目前，水利工程设计、勘测、施工、监理等招投标工作已在上海市全面展开，并积累了大量的宝贵经验，取得了良好的社会效益和经济效益。当前，除了要继续提高公开招标率和招标质量外，应该试行和逐步推广建设单位、管理运行单位、养护单位招投标制，从提高管理水平、节约投资、防腐促廉等方面来讲，实行建设单位、管理运行单位、养护单位招投标制是非常有益和必需的，也符合机构改革的需要和市场经济的运行规则，但要实施和推行，目前还存在以下几方面的问题：
（1）市场的准入，市场的准入主要受资质的控制，水利工程建设、管理、养护单位目前都没有明确的资质评定、管理办法，建议有关部门要尽快制定相应的规章、制度.
（2）机构体制，水利工程的建设单位是由政府指定的，管理、养护单位是具有行政行为的事业单位，专业化、社会化、企业化是建设、管理、养护单位今后的发展方向，建设、管理、养护单位都应该成为符合《公司法》规定的有承担民事责任能力的企业，同时其财务管理机制也应随之改变；
（3）责任和监督，水利工程，特别是公益性水利工程的建设投资，主要是由国家财政出资的，其产出的效益主要是社会效益，因此，在引进建设、管理、养护单位招投标制后，有关部门应制定相关法律来明确工程建设.
，海市水利工程招标投标工作的现状及展望